Kompleksowa, integratywna analiza genomowa glejaków rozproszonych niższego stopnia AD 7

DM / HSR oznacza dwuminutowe chromosomy lub obszary jednorodnie zabarwione. Panel B pokazuje częstotliwości we wskazanych podtypach molekularnych LGG zdarzeń mutacyjnych, które są powszechnie spotykane w GBM z IDH typu dzikiego, w tym LGG z mutacją IDH i kodowaniem p / 19q (85 próbek), mutacją IDH i brakiem kodowania (141), i IDH typu dzikiego (56). SNV oznacza wariant pojedynczego nukleotydu i wariant strukturalny SV. Różnice częstości mutacji w zależności od stopnia złośliwości nowotworu przedstawiono na ryc. S21 w dodatku uzupełniającym 1. Zidentyfikowaliśmy istotne różnice w zmianach liczby kopii DNA i mutacjach genów wśród trzech podtypów molekularnych (rysunek 2, rysunek 3 i rysunek 4 oraz rys. S8 i S14 w dodatkowym dodatku 1, tabela S3 [dodatek dodatkowy 3] i tabela S4 w Uzupełniającym dodatku 1). Znaleźliśmy mutacje CIC w 62% i mutacje FUBP1 w 29% glejaków niższego stopnia z mutacją IDH i kodowaniem 1p / 19q, ale nie znaleźliśmy tych mutacji w innych podtypach molekularnych. Wśród glejaków niższego stopnia z mutacją IDH i kodowania 1p / 19q, obserwowaliśmy również mutacje w genach szlaku kinazy PI3 genów PIK3CA (20%) i PIK3R1 (9%) 29 oraz w NOTCH1 (31%), 29-31 również jako nowe mutacje w ZBTB20 (9%) i ARID1A (6%) (Figura 2). Ponadto, wśród glejaków niższego stopnia z mutacją IDH i kodowaniem 1p / 19q, 96% miało aktywujące mutacje promotora TERT, co prowadziło do podwyższonej ekspresji TERT; Mutacje ATRX były rzadkie w tych nowotworach, co jest zgodne ze wzajemną wyłącznością mutacji ATRX i TERT14,32 (Figura 2 i Figura 3). Obserwowano ogniskową amplifikację 19p13.3 (fig. 3 i fig. S14A w dodatkowym dodatku 1), ale zaobserwowano tylko kilka powtarzających się zmian liczby kopii w całym ramieniu innych niż kodowanie 1p / 19q (fig. S8B w dodatkowym dodatku 1). Różnice w częstości występowania mutacji i wzorzec zmian liczby kopii pomiędzy glejakami niższego stopnia stopnia II i stopnia III z mutacją IDH i kodowaniem 1p / 19q były niewielkie (Figura 5A i fig. S21 w Dodatku 1).
Ogólnie, dane sugerują, że glejaki o niższym stopniu złośliwości z mutacją IDH i kodowaniem p / 19q są biologicznie dyskretne i powstają z sekwencji mutacji IDH, kodowania p / 19q i aktywacji TERT; mutacja CIC i FUBP1; i aktywujące zmiany w szlaku kinazy PI3.29,31,32 Mutacje NOTCH1 w tym podgrupie nowotworów prawdopodobnie dezaktywują gen, ponieważ występują w pozycjach podobnych do mutacji nieaktywnych NOTCH1 w płucach, głowie i szyi oraz rakach szyjki macicy, a nie w miejscach aktywacji34 (ryc. S15 w Uzupełniającym dodatku 1). Wyniki analizy PARADIGM-SHIFT35 (ryc. S16 w dodatku 1), w której oceniane są docelowe punkty końcowe w celu oceny statusu szlaku, również sugerują, że mutacje NOTCH1 powodują dezaktywację funkcji białka NOTCH1
[przypisy: dyżur aptek września, przewlekłe zapalenie woreczka żółciowego, lewomepromazyna ]

Powiązane tematy z artykułem: dyżur aptek września lewomepromazyna przewlekłe zapalenie woreczka żółciowego